气相色谱仪和液相色谱仪的主要区别在于它们的应用场景，以及分离物质的原理不同。
气相色谱仪是通过将样品放入离子化坩埚中，将混合物离子化为带有正负电荷的离子，然后将其运行在电场中，由于不同离子散射率的不同，混合物分离出来。
而液相色谱仪则是将溶剂放入柱体内作为运载，混合物通过溶剂从柱体上渗出，由于不同物质的引力吸附速度不同，以及不同物质的溶解度不同，使得混合物可以分离出来。
此外，气相色谱仪和液相色谱仪也有其他的不同，如气相色谱仪可以测量低分子量的物质，而液相色谱仪测量高分子量的物质，在操作上，气相色谱仪的操作相对较简单，而液相色谱仪的操作则较为复杂，此外，气相色谱仪的数据收集时间通常会比液相色谱仪短。
